항체 (또는 항체 유사물질) 발명을 특허 보호 받는 방법과 관련하여 다음과 같은 목차로 설명 합니다.
지난 글들을 통해서 항체 발명의 유형과 EPO의 심사기준, 유형별 최근 BoA 판결에 대해 살펴보았습니다.
이번에는 에피토프로 정의된 항체에 대해 집중적으로 분석해보고자 합니다. 에피토프로 정의되는 항체 발명의 유형이 무엇인지 알아보고 각 유형별로 어떤 요건들을 유의하여야 할지 살펴보겠습니다.
가. Epitope 정의된 발명에 대한 EPO의 특허요건
에피토프로 정의하는 방식은 구조로 정의하는 방법에 비해 포괄적인 권리를 받을 수 있기 때문에 포괄적인 권리가 필요할 경우에 선호되는 방식입니다. USPTO에서 에피토프로 정의된 항체 발명은 엄격한 Written description 요건으로 인해 보호가 어려운 것으로 보입니다. 하지만 EPO에서는 심사기준에서 이를 허용하고 있으며 다만 아래와 같은 요건이 있습니다(G.II.5.6.1.6).
“…the application must provide an enabling disclosure allowing the skilled person to determine whether further antibodies bind this epitope. The application must also enable the production without undue burden of additional antibodies binding to the same epitope”
즉, 명세서는 어떻게 (실시예 말고) 다른 항체가 에피토프에 결합하는지 “결정”하는 것인지 용이하게 파악되어야 하고, 어떻게 (실시예 말고)다른 항체를 당업자가 과도한 부담 없이 “생산”할 수 있는 것인지 알 수 있어야 합니다.
이와 같이 구조로 정의하는 항체 발명에 비해 충분성 요건에 대한 허들이 있습니다.
에피토프에는 위와 같이 linear 에피토프가 있는 반면, conformational 에피토프가 존재합니다. Linear 에피토프의 경우 결합 여부 및 결합 항체의 생산이 비교적 용이할 것입니다. 그러나, conformational 에피토프는 상대적으로 이러한 파악이 어려울 것입니다.
따라서, 에피토프 구조가 복잡할 수록, 충분성 요건을 달성하기가 어려울 것이고 대신 신규성/진보성 요건의 달성이 용이할 것입니다.
나. 에피토프 맵핑에 대한 배경기술
에피토프 맵핑은 매우 복잡한 과정이고 어떤 표준적인 결정 방식이 있다고 말하기 어려운 것 같습니다. 기존에 존재하는 아래와 같은 맵핑 기술을 간략히 살펴보고 관련된 청구항 작성 및 데이터 요건을 검토해보겠습니다.
• Competitive binding (경쟁적 결합에 의해 식별)
• Mutagenesis (변이를 통해 결합 부위 식별)
• Pepscan (일정길이의 단편 절단을 통해 결합 부위 식별)
• X-ray crystallography
1). Competitive binding
먼저, reference antibody와의 경쟁적 결합 여부를 통해 에피토프를 맵핑하는 방식이 있습니다.
따라서 청구항을 작성할 때에도 ‘reference antibody’를 정해두고 이와 동일한 에피토프에 결합하는 방식이라고 정의할 수도 있겠습니다. 혹은 이와 동일한 에피토프를 두고 경쟁하는 방식이라고 정의할 수도 있겠습니다.
동일한 에피토프라고 정의할 경우에는 어떤 방법으로 동일한 에피토프임을 평가할 수 있을지가 이슈가 될 것입니다.
또한, 경쟁적으로 작용한다고 정의할 경우에는 얼마나 경쟁하는지 입체적인 hindrance로 경쟁하는 것인지 여부가 명확해야 할 것으로 보입니다.
2). Mutagenesis
항원 단백질의 변이를 일으켜 결합부위를 찾는 방식입니다. 이러한 맵핑방식의 문제점은 3D 구조를 변형할 수 있어 conformational epitope를 찾을 때는 신뢰할만하지 않는 점입니다.
3). Pepscan
항원 부위의 일정 단편을 내어 항체가 결합하는 부위를 찾는 것입니다. 마찬가지로 선형 에피토프에 보다 적합하게 적용될 수 있고, conformational 에피토프 식별에는 적합하지 않습니다.
4). X-ray crystallography
X-ray 결정법은 가장 정확하게 conformational 에피토프를 식별하는데 사용될 수 있습니다. 하지만 이 기술의 문제점은 비용이 상당하고 시간이 많이 소모됩니다. 따라서, 이러한 방식으로 당업자가 용이하게 (실시예가 아닌) 다른 항체를 스크리닝할 수 있다고 말하기 어려울 수 있습니다.
다. 에피토프로 항체가 정의될 수 있는 유형
전술한 맵핑에 대한 기술을 통해, 항체는 다음과 같은 유형으로 정의될 수 있습니다:
(1) 에피토프의 구조 자체
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유형 |
예시 청구항 |
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Linear epitope |
1. A monoclonal antibody or an antigen-binding fragment thereof that specifically binds to an epitope within or overlapping amino acids 20-326 of SEQ ID NO: 1. |
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Conformational epitope |
1. An isolated monoclonal antibody or immunologically active fragment thereof that binds to human CD47, wherein the antibody or immunologically active fragment thereof binds to a discontinuous epitope on CD47, wherein the discontinuous epitope comprises amino acids residues Y37, K39, K41, K43, G44, R45, D46, D51, H90, N93, E97, T99, E104, and E106 of CD47 when numbered in accordance with SEQ ID NO: 147 |
(2) 참조 항체를 통해 에피토프를 정의
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유형 |
예시 청구항 |
| 참조 항체와 동일한 에피토프를 결합 |
1. A monoclonal antibody or an antigen-binding fragment thereof that specifically binds to an epitope within or overlapping amino acids 20-326 of SEQ ID NO: 1. |
| 참조 항체와 에피토프를 경쟁적으로 결합 |
1. An isolated monoclonal antibody or immunologically active fragment thereof that binds to human CD47, wherein the antibody or immunologically active fragment thereof binds to a discontinuous epitope on CD47, wherein the discontinuous epitope comprises amino acids residues Y37, K39, K41, K43, G44, R45, D46, D51, H90, N93, E97, T99, E104, and E106 of CD47 when numbered in accordance with SEQ ID NO: 147 |
다음 글에서는 이들 유형 별로 사례들을 살펴보고 EPO의 판단기준에 대해 말씀 드리겠습니다. 다음 글 바로 가기
